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9月9日，两市股指低开低走，盘中大幅下探，沪指一度跌逾2%，深成指跌近4%，创业板指大跌逾5%。随后三大股指探底回升，跌幅有所收窄。创业板指早盘表现仍较为活跃，成交量有所放大，半日成交超2400亿元。北向资金再度大幅净流出。
截至午间收盘，沪指跌1.07%报3280.96点，深成指跌2.21%，创业板指跌3.46%。北向资金净流出25.38亿元。
板块方面，受一则利空消息刺激，生物疫苗概念大跌，康泰生物大跌逾19%，逼近跌停；万泰生物、海利生物跌停，智飞生物跌幅超9%。食品饮料、半导体、农业、软件板块等大幅走低。分散染料概念走强，锦鸡股份涨停，安诺其一度涨逾10%；氢能源概念表现活跃，中泰股份、深冷股份、厚普股份等涨停，四方达、富瑞特装涨幅超10%。工程机械、钢铁、煤炭、电力等板块震荡走高，银行、地产板块小幅上扬，券商板块亦有所反弹。
创业板方面，个股表现总体较为活跃。银邦股份、中泰股份、深冷股份等逾10股涨停，板块内逾30股涨幅超10%。
近期，“天山生物（维权）”、“豫金刚石（维权）”、“长方集团”等少数流通市值小、价格低、基本面差的创业板股票股价短期快速上涨，炒作现象较为突出，受到市场高度关注。9月8日“天山生物”触发异常波动标准，深交所依规再次对其要求停牌核查。同时，根据监控情况，“豫金刚石”“长方集团”交易与“天山生物”具有相似特征，均触发严重异常波动标准，深交所对两家公司要求停牌核查。
长城证券指出，近期低价股吸引了更多的短线资金参与博弈，市场交易量出现了明显的倾斜。短线资金博弈创业板低价股的投机心理有所增强，吸引不少散户投资者的跟风。由于很多低价股的基本面整体较差，投资者参与这类个股的博弈仍需要提高警惕。
粤开证券指出，目前市场主要有两大看点：（1）关注外盘走势以及对A股的扰动情况。（2）关注杀跌主力消费、医药、科技板块的后市走势。消费板块作为目前A股核心资产，由于其业绩确定以及受益经济内循环，可将估值范围适当放宽。不过长期来看，科技板块仍应是大势所趋，关注高端装备、信息技术的国产替代主线，待其业绩确定性提升后，市场有望迎来风格转变。
配置方向上，市场中短期预计仍为宽幅震荡格局，经过前期多次冲关未果后，股指有可能探寻箱体下轨区域，稳健投资者需耐心等待，料外围扰动平稳之后才能结束横盘局面。中短期可关注（1）优先补库存的周期性行业；（2）必需和可选消费品龙头；（3）高弹性成长股；（4）金融板块，银行、保险、券商一方面目前估值较低，有补涨机会，另一方面有业绩支撑。如果金融股能够仿照2015年牛市中2014年末行情，引领整体市场情绪，则有望带动指数回升。长期来看，看好科技和金融两条主线。
